El CIBAAL se encuentra ubicado en el predio de la Facultad de Agronomía y Agroindustrias sobre el cruce de la Ruta Nacional 9 Km 1125, en Villa El Zanjón (G4206XCP) Santiago del Estero.
El CIBAAL surge como respuesta a la incitativa de grupos de investigación de Biofísica y Alimentos, originalmente nucleados en el Centro de Investigación y Transferencia de Santiago del Estero (CITSE), que se propusieron la creación de un centro multidisciplinario que permitiera actuar como un polo de desarrollo distintivo en el estudio de sistemas complejos y sus implicancias innovadoras en la transferencia al sector alimentario.
El mismo fue creado formalmente en diciembre de 2017 bajo la dirección de la Dra. Laura Iturriaga.